PERSONA -trinity soul-

Het verhaal speelt zich af, 10 jaar na de plot van de videogame "Persona 3" - waar de held het einde van de wereld vermeed veroorzaakt door "schaduwen" - in de stad Ayanagi, vlakbij de Zee van Japan. Deze stad werd gebouwd om de schade te verlichten die was veroorzaakt door de plaag van het "Apathie Syndroom", die tien jaar eerder plaatsvond. Een middelbare scholier, Shin Kanzato, en zijn jongere broer Jun keren terug naar het huis van hun oudere broer Ryo. Deze laatste is al tien jaar hoofd van de politie van Ayanagi. Op dit moment vindt er een reeks vreemde gebeurtenissen plaats in de stad Ayanagi, zoals de plotselinge verdwijning van de bemanning van een onderzeeër tijdens het duiken of het geval van het onherkenbare lichaam van een student die een gruwelijk uiterlijk heeft aangenomen. Ryo spoort de organisatie achter deze opeenvolging van incidenten op en gebruikt zijn "Persona" - astrale lichaamsprojectie om te vechten tegen "schaduwen".